10 à 26 membres, dont le président, composent le conseil d'administration. Élus pour 4 ans à bulletin secret par les membres participants et honoraires, les administrateurs sont des bénévoles. Leur mandat est renouvelable, par moitié, tous les deux ans.
Le conseil d'administration se réunit, à l'initiative du président, minimum 3 fois par an et détermine les orientations de la mutuelle et veille à leur application. Il opère les contrôles qu'il juge opportuns. À la clôture de chaque exercice, le conseil d'administration arrête les comptes annuels et établit les rapports de gestion et de solvabilité. Pour délibérer valablement, la moitié des effectifs doit être au minimum présente.